Jyväskylän yliopiston nanotiedekeskuksen tutkijat ovat kehittäneet anturin, joka tunnistaa enteroviruksen perimän huomattavasti aiempaa herkemmin.
Virus-rna:n havaitseva uudenlainen sensori perustuu suhteelliseen fluoresenssiin.
”Tutkimuksemme on monitieteinen ponnistus, jossa yhdistyy biologian, kemian ja fysiikan asiantuntemus”, kertoo fysiikan professori Jussi Toppari.
Uusi, paranneltu suhteellinen fluoroanturi hyödyntää viruksen rna:n tunnistamisen koettimena hiilinanopisteitä (Carbon Dot, CD), etidiumbromidia (EB) ja yksijuosteista dna-fragmenttia.
Jyväskyläläistutkimus on julkaistu Carbon-lehdessä.
Uutuus päihittää selvästi perinteisen
Fluoresoivista nanohiukkasista on tullut tehokkaita työkaluja bioanalyyttien havaitsemiseen. Juuri hiilinanopiste on helpon valmistuksen, vakauden ja myrkyttömyyden ansiosta yksi kiinnostavimmista.
Uusi funktionalisoitu anturi, jossa CD:t on kovalenttisesti sidottu koettimeen, päihittää selvästi perinteisen ei-funktionalisoidun anturin, kertoo väitöskirjatutkija Amar Raj.
Perinteisessä non-func-anturissa CD:t, koetin ja EB on vain sekoitettu keskenään.
Non-func-anturi havaitsi kohde-dna:n uutta func-sensoria huonommin, eikä se toiminut aidoilla enteroviruksen rna-näytteillä lainkaan.
Työkalu infektion varhaiseen diagnosointiin
Tutkija Abhishek Pathakin mukaan func-anturi osoitti sekä paljon korkeampaa herkkyyttä dna:n ja aidon viruksen rna:n osalta että myös selvästi parempaa selektiivisyyttä.
Erityisen merkittävä asia on, että func-anturi kykenee bongaamaan enteroviruksen rna:n vapautumisen reaaliaikaisesti.
Uutuus tarjoaa siis kipeästi kaivatun mahdollisuuden viruksen rna:n reaaliaikaiseen havaitsemiseen infektion aikana, selventää solu- ja molekyylibiologian professori Varpu Marjomäki.
Tutkimusryhmä pyrkii seuraavaksi korvaamaan mahdollisesti vaarallisen väriaineen etidiumbromidin turvallisemmilla, vähemmän sytotoksisilla ja biologisesti yhteensopivilla väriaineilla.
Päivi Ikonen
Tilaa Kemiamedian uutiskirje!
Tilaajana saat sähköpostiisi kerran viikossa kiinnostavimmat uutiset ja tiedot alan tapahtumista ja työpaikoista. Osallistut samalla arvontaan!
